O PPGH – UFC conta com parcerias e convênios com a FUNCAP (Fundação Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico), BNB (Banco do Nordeste do Brasil), FCPC (Fundação Cearense de Pesquisa e Cultura), CNPq, CAPES/PAEP, Ministério da Educação (no caso do PETHistória), SECULT (Secretaria da Cultura do Estado do Ceará), Arquivo Público do Estado e Instituto Frei Tito de Alencar.
As parcerias internacionais estabelecidas pelo programa envolvem relações recíprocas de intercambio, configurando bases interessantes em curso de consolidação com diversas instituições: Universidade do Chile, Universidad de Cuenca (Equador), Universidade de Queretáro (México), Universidade de Indiana (USA).
Convênios mais antigos e parcerias já consolidadas (envolvendo pesquisas, projetos de formação, missões de trabalho e produções em comum) existem com instituições portuguesas (sobretudo Universidade de Coimbra), espanholas (Universidades de Barcelona principalmente e Universidade de Sevilla), francesas (Universidade de Toulouse-Jean Jaurès- UT2J, agora Toulouse Jean Jaurès (UT2J), IPEALT/GRAL (Institut Pludisciplinaire pour les Etudes sur l’Amerique Latine de Toulouse/Groupe de Recherche l’Amerique Latine) e o laboratório de pesquisa FRAMESPA (UMR/CNRS 5136), têm garantido trocas significativas ao longo dos últimos anos. Além da participação de docentes da UFC em seus seminários e congressos, tivemos a presença constante de profissionais dessas universidades.
Além de parcerias e convênios internacionais, também estabelecemos acordos de troca e colaboração com outros PPG nacionais. O convênio estabelecido com os Programas de Pós-Graduação em História da Universidade Federal de Pernambuco (UFPE), Universidade Federal do Pará (UFPA) e, posteriormente, Universidade Federal do Mato Grosso (UFMT) visando o estabelecimento de uma Rede Norte-Nordeste dos Programas de Pós-Graduações, possibilitou a criação do Seminário Internacional de História e Historiografia, o qual possui realização bianual e conta com a participação de importantes nomes da historiografia nacional e internacional.